Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtn4Q99P72 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtn4Q99P72 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms