Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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