Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ms4a4dQ99N05 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ms4a4dQ99N05 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4dQ99N05 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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