Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms