Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nmd3Q99L48 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms