Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ciao1Q99KN2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms