Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms