Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim7Q923T7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms