Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SelenomQ8VHC3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenomQ8VHC3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms