Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc71Q8VEG0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc71Q8VEG0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc71Q8VEG0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc71Q8VEG0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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