Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9Q8VC31 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms