Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r72Q8K3N7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r72Q8K3N7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms