Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms