Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnma3Q8JZW8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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