Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC7

Klre1, Killer cell lectin-like receptor subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klre1Q8CJC7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Klre1Q8CJC7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms