Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Amigo3Q8C2S7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Amigo3Q8C2S7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms