Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actrt3Q8BXF8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms