Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms