Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIV3

Ranbp6, Ran-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ranbp6Q8BIV3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Ranbp6Q8BIV3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Ranbp6Q8BIV3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Ranbp6Q8BIV3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Ranbp6Q8BIV3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Ranbp6Q8BIV3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ranbp6Q8BIV3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Ranbp6Q8BIV3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ranbp6Q8BIV3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ranbp6Q8BIV3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Ranbp6Q8BIV3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Ranbp6Q8BIV3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Ranbp6Q8BIV3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ranbp6Q8BIV3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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