Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbfox3Q8BIF2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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