Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms