Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Vipas39Q8BGQ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Vipas39Q8BGQ1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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Vipas39Q8BGQ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Vipas39Q8BGQ1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Vipas39Q8BGQ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Vipas39Q8BGQ1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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