Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Smim19Q80ZU4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Smim19Q80ZU4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Smim19Q80ZU4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smim19Q80ZU4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim19Q80ZU4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim19Q80ZU4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Smim19Q80ZU4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Smim19Q80ZU4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Smim19Q80ZU4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Smim19Q80ZU4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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