Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dsg4Q7TMD7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg4Q7TMD7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms