Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nme8Q715T0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms