Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d2bQ6ZWY6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms