Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPF4

Fmnl3, Formin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmnl3Q6ZPF4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fmnl3Q6ZPF4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms