Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-M2Q6W9L1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M2Q6W9L1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms