Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q5P6

TY4A-H, Transposon Ty4-H Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4A-HQ6Q5P6 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt5.37□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 YKE4YIL023C 1041 nt5.37□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 YVH1YIR026C 1095 nt5.37□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 UTP30YKR060W 825 nt5.37□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 YNL109WYNL109W 546 nt5.37□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 TOM22YNL131W 459 nt5.37□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.37□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 NGL1YOL042W 1092 nt5.37□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.37□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 SLF1YDR515W 1344 nt5.37□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 ARP4YJL081C 1470 nt5.37□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 GPR1YDL035C 2886 nt5.36□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 YDR269CYDR269C 324 nt5.36□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 AUA1YFL010W-A 285 nt5.36□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 BIG1YHR101C 1008 nt5.36□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 YHR125WYHR125W 306 nt5.36□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 YMR254CYMR254C 309 nt5.36□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 MRM1YOR201C 1239 nt5.36□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 ISU2YOR226C 471 nt5.36□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 AVT5YBL089W 1380 nt5.36□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 FRS1YLR060W 1788 nt5.36□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 TDA7YNL176C 1911 nt5.36□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 CAF4YKR036C 1932 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 SIF2YBR103W 1608 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 UGA2YBR006W 1494 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 TFA1YKL028W 1449 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 DAD1YDR016C 285 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 ATG31YDR022C 591 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 YFL051CYFL051C 483 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 RPL28YGL103W 450 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 YKL131WYKL131W 522 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 YPT7YML001W 627 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 HLJ1YMR161W 675 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 YNR021WYNR021W 1215 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 DSS4YPR017C 432 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 ARL1YBR164C 552 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 SEC66YBR171W 621 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 IKS1YJL057C 2004 nt5.35□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 SMF1YOL122C 1728 nt5.34□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 DNF2YDR093W 4839 nt5.34□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 CHK1YBR274W 1584 nt5.34□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 TSL1YML100W 3297 nt5.34□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 EMP46YLR080W 1335 nt5.34□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 FIN1YDR130C 876 nt5.34□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 SDC1YDR469W 528 nt5.34□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 ZRT1YGL255W 1131 nt5.34□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt5.34□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 UBX4YMR067C 1251 nt5.34□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 ERD2YBL040C 660 nt5.34□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 ATG8YBL078C 354 nt5.34□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 KIP2YPL155C 2121 nt5.34□□□□□ -1.55
TY4A-HQ6Q5P6 CLF1YLR117C 2064 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 RGP1YDR137W 1992 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 STR2YJR130C 1920 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 LAP3YNL239W 1365 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 HCA4YJL033W 2313 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 ADY2YCR010C 852 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 RPL27BYDR471W 411 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 IZH1YDR492W 951 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 VFA1YER128W 612 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 VMA22YHR060W 546 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 CDC12YHR107C 1224 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 SDP1YIL113W 630 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 DAL3YIR032C 588 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 RPL40BYKR094C 387 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 YOR248WYOR248W 303 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 RBL2YOR265W 321 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.33□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 POL31YJR006W 1464 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 YND1YER005W 1893 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 JJJ1YNL227C 1773 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 YER085CYER085C 522 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 SEC4YFL005W 648 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 RPN12YFR052W 825 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 YAP3YHL009C 993 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 SPL2YHR136C 447 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 RPL16AYIL133C 600 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 YIL161WYIL161W 708 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 YJR037WYJR037W 384 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 ACP1YKL192C 378 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 RPS19BYNL302C 435 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 MRP21YBL090W 534 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 DDP1YOR163W 567 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 CMR3YPR013C 954 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 YPR197CYPR197C 564 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 PBN1YCL052C 1251 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 VID30YGL227W 2877 nt5.32□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 GAS4YOL132W 1416 nt5.31□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 VPS17YOR132W 1656 nt5.31□□□□□ -1.56
TY4A-HQ6Q5P6 AML1YGR001C 747 nt5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.2 ms