Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gramd2bQ6PEM6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms