Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd4Q6PDQ2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms