Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf2Q6P9P0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms