Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frg2f1Q6P3A2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frg2f1Q6P3A2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frg2f1Q6P3A2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frg2f1Q6P3A2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frg2f1Q6P3A2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frg2f1Q6P3A2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frg2f1Q6P3A2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frg2f1Q6P3A2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frg2f1Q6P3A2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frg2f1Q6P3A2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Frg2f1Q6P3A2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Frg2f1Q6P3A2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Frg2f1Q6P3A2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms