Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt87Q6IMF0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms