Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edrf1Q6GQV7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edrf1Q6GQV7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 439.2 ms