Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zcchc2Q69ZB8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zcchc2Q69ZB8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms