Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms