Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Top2bQ64511 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Top2bQ64511 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Top2bQ64511 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2bQ64511 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms