Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ca4Q64444 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ca4Q64444 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ca4Q64444 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ca4Q64444 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ca4Q64444 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ca4Q64444 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ca4Q64444 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ca4Q64444 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ca4Q64444 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ca4Q64444 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms