Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ccdc18Q640L5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
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