Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PatjQ63ZW7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms