Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Ttf1Q62187 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ttf1Q62187 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf1Q62187 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ttf1Q62187 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Ttf1Q62187 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Ttf1Q62187 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Ttf1Q62187 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Ttf1Q62187 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Ttf1Q62187 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ttf1Q62187 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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