Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms