Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc27a1Q60714 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc27a1Q60714 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms