Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc11Q5U458 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms