Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r195Q5SVD6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms