Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms