Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms