Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCX5

Neurl4, Neuralized-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl4Q5NCX5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurl4Q5NCX5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurl4Q5NCX5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms