Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms